Mientras que las intervenciones quirúrgicas en los órganos genitales provocan una pérdida permanente de la fertilidad, los tratamientos hormonales para la afirmación de género provocan reducciones variables (pero probablemente reversibles) de la capacidad reproductiva.
Anticoncepción en personas transgénero asignadas como hombres al nacer 
Aunque es probable que la terapia con estrógenos y antiandrógenos pueda perjudicar la producción de espermatozoides (espermatogénesis), no se puede descartar que la penetración vaginal con una persona asignada como mujer al nacer pueda causar un embarazo. Por este motivo, en caso de no desearlo, se recomienda el uso del preservativo. Como alternativa, se puede pedir a la pareja asignada como mujer al nacer (con un aparato reproductor femenino en funcionamiento) que utilice un método anticonceptivo alternativo (por ejemplo, la píldora anticonceptiva). El uso de preservativos, a diferencia de otros métodos anticonceptivos, también es útil para prevenir las infecciones de transmisión sexual. Sin embargo, su uso puede ser difícil para una persona transgénero que sigue una terapia hormonal de afirmación del género, debido a la posible reducción de la tumescencia (erección incompleta).
Anticoncepción en personas transgénero asignadas como mujer al nacer
La testosterona utilizada en el tratamiento de las personas transgénero asignadas como mujer al nacer induce la desaparición del ciclo menstrual en un periodo que va de 1 a 12 meses después de la primera administración en la mayoría de los casos. Sin embargo, la ausencia de ciclos menstruales no significa la ausencia de ovulación, lo que implica un riesgo de embarazo. Se han señalado pocos casos de embarazos no deseados durante la toma de hormonas masculinizantes, por lo que el tratamiento con testosterona no puede considerarse una opción anticonceptiva válida y eficaz, además de tener efectos teratogénicos en el feto. 
La testosterona no constituye una contraindicación para ningún tipo de anticoncepción hormonal. Sin embargo, no tenemos información sobre la mejor opción anticonceptiva en la población que toma esta hormona, ni sabemos si ciertos efectos pueden mantenerse, amplificarse o reducirse cuando se toman anticonceptivos junto con la testosterona. Cada método tiene algunas ventajas y desventajas, por lo que la elección del anticonceptivo debe discutirse con el médico y adaptarse a las preferencias y necesidades de la persona en cuestión.
A continuación se presentan algunas opciones de anticonceptivos con las posibles ventajas y desventajas de cada formulación en personas transgénero asignadas como mujer al nacer:
Implante subcutáneo
¿Qué es?
Se trata de una varilla de un tipo especial de plástico fino y flexible, de 4 cm de largo y 2 mm de diámetro, que contiene 68 miligramos de la hormona progestágena etonogestrel (una hormona similar a la progesterona natural pero sintetizada en laboratorio). Se inserta bajo la piel en la zona interna de la parte superior del brazo (izquierda o derecha). Permanece en este lugar durante tres años y al final del tercer año tiene que ser retirada. Se inserta y se extrae a través de una pequeña incisión realizada por el médico en el ambulatorio. Durante la inserción y la extracción, se administra un anestésico local para reducir las molestias. Una vez insertada, no es visible a simple vista, por lo que es muy discreto.
Ventajas:

• no contiene estrogéno, comúnmente considerado como la hormona femenina que mayormente contrarresta el efecto masculinizante de la testosterona;
• puede permanecer en su lugar durante 3 años;
• es el método anticonceptivo más eficaz para prevenir el embarazo;
• el modesto efecto androgénico de la hormona contenida en el dispositivo puede actuar en sinergia con la terapia de testosterona, o al menos no la contrarresta;
• no hay implicación del aparato genital para su colocación.

Desventajas:

• procedimiento de inserción que requiere la administración de anestesia local;
• posibles sangrados genitales persistentes e irregulares, que probablemente se limiten en caso de uso concomitante de testosterona.

Dispositivos intrauterinos (con cobre o levonorgestrel)
¿Qué es?
Se trata de un dispositivo en forma de T. Según el tipo, puede contener cobre o plata o una pequeña cantidad de la hormona progestágena levonorgestrel (una hormona similar a la progesterona natural, pero sintetizada en laboratorio). Se inserta en el interior del útero y puede permanecer allí durante 3, 5 o 10 años, dependiendo del tipo.

Ventajas:

• no contiene estrógeno, comúnmente considerado como la hormona femenina que mayormente contrarresta el efecto masculinizante de la testosterona;
• una vez colocado en el interior del útero, puede permanecer en él de 3 a 5 o incluso hasta 10 años;
• es uno de los métodos anticonceptivos más eficaces para prevenir el embarazo;
• el dispositivo intrauterino que contiene progestágeno actúa principalmente en el útero, pero una pequeña cantidad de hormona puede entrar en la circulación. Esto tiene un efecto androgénico y puede actuar en sinergia con la terapia de testosterona, o al menos no la contrarresta.

Desventajas:

• la colocación de estos dispositivos requiere un procedimiento ginecológico;
• posible sangrado y dolor en la inserción y en el post operatorio;
• el dispositivo intrauterino que contiene cobre puede provocar un aumento del flujo menstrual.

Píldora anticonceptiva que contiene solo progestágeno
¿Qué es?
Píldora que contiene la hormona progestágena desogestrel o drospirenona (hormonas similares a la progesterona natural pero sintetizadas en laboratorio) que se toma diariamente por vía oral.
Ventajas:

• no contiene estrógeno, comúnmente considerado como la hormona femenina que mayormente contrarresta el efecto masculinizante de la testosterona;
• ingestión oral;
• un efecto androgénico mínimo del desogestrel, que por lo tanto puede actuar en sinergia con la terapia de testosterona, o al menos no contrarrestarla;
• no se requiere ningún procedimiento ginecológico.

Desventajas:

• debe tomarse a diario;
• el control de las pérdidas hemáticas genitales que se consigue con este método podría no ser el mejor, aunque no se dispone de información sobre su uso simultáneo con testosterona;
• posible reducción de la eficacia en caso de trastornos gastrointestinales (diarrea) o si se toman algunos medicamentos al mismo tiempo.

Píldora anticonceptiva que contiene estroprogestágenos
¿Qué es?
Píldora que contiene tanto la hormona estrógeno como la progestina (hormonas similares al estrógeno y la progesterona naturales, pero sintetizadas en laboratorio), que se toma diariamente por vía oral.
Ventajas

• ingesta oral;
• proporciona un buen control del sangrado genital, especialmente cuando se toma sin interrupción;
• no es necesario ningún procedimiento ginecológico.

Desventajas:

• contiene estrógeno que puede interferir con el efecto masculinizante de la testosterona;
• debe tomarse a diario;
• ligero aumento del riesgo de tromboembolismo;
• posible tensión mamaria;
• posible reducción de la eficacia en caso de trastornos gastrointestinales (diarrea) o si se toman algunos medicamentos al mismo tiempo.

Anillo vaginal
¿Qué es?
Un dispositivo en forma de anillo fabricado con un tipo especial de plástico, flexible y fino, con un diámetro de 54 mm y un espesor de 4 mm. Debe colocarse en la vagina y sustituirse una vez al mes. En contacto con la pared vaginal, el anillo libera estrógeno y progestina (hormonas similares al estrógeno y progesterona natural, pero sintetizadas en el laboratorio).
Ventajas:

• ofrece un buen control del sangrado genital;
• se mantiene en su lugar durante 3 semanas.

Desventajas:

• contiene estrógeno que pueden interferir con el efecto masculinizante de la testosterona;
• la implicación del aparato genital para su colocación;
• leve aumento del riesgo tromboembólico;
• posible tensión mamaria;
• posible reducción de la eficacia cuando se toman algunos medicamentos al mismo tiempo.

Los tabúes y los estereotipos pueden influir negativamente en la sexualidad, por lo que en esta sección intentaremos aclarar algunos aspectos y disipar mitos falsos.
Soy un chico transgénero y me atraen los hombres, ¿hay algo extraño en mí?
La orientación sexual y la identidad de género son dos conceptos distintos e independientes. Al igual que una persona cisgénero, una persona transgénero puede, por ejemplo, sentirse atraída por un hombre, una mujer, ambos o por otra persona transgénero. Por supuesto, esto también es así en el caso de una chica transgénero. Por lo tanto, la orientación sexual no es un aspecto que interfiera en el eventual proceso de afirmación de género. Sin embargo, en algunos casos puede ser útil pedir apoyo a un profesional para aclarar dudas sobre posibles cambios sexuales debidos a la terapia de afirmación de género o a posibles terapias anticonceptivas.
No me interesa la sexualidad en esta etapa de mi vida, ¿debo preocuparme?
Puede ocurrir que la sexualidad de las personas transgénero se vea comprometida por la incomodidad con su cuerpo y el miedo a no ser reconocidas por cómo se sienten. Es posible que quieran evitar nuevas relaciones o que no se interesen en la sexualidad. Los profesionales de la salud transgénero pueden proporcionar apoyo en esta etapa para afrontar la propia sexualidad con más calma. Además, el malestar con el propio cuerpo a menudo puede disminuir espontáneamente durante el proceso de afirmación de género, lo que permite vivir mejor la propia sexualidad. Sin embargo, si la sexualidad es una fuente persistente de angustia, puede ser útil consultar a un sexólogo con experiencia en salud transgénero para evaluar intervenciones específicas (apoyo psicológico o medicamentos).
¿Cómo cambiará la sexualidad después de la operación?
La decisión de someterse o no a la cirugía de afirmación de género es una opción que sólo algunas personas transgénero eligen. Al tomar esta decisión, es ciertamente importante ser consciente de las posibles consecuencias de la cirugía de afirmación de género en la sexualidad. Esto requiere una evaluación cuidadosa de los aspectos que podrían mejorarse (por ejemplo, una mejor relación con el propio cuerpo), pero también de las posibles limitaciones, que varían según la experiencia del profesional y las peculiaridades del caso individual. Por lo tanto, es importante que las personas estén detalladamente informadas y tengan expectativas realistas. Además, puede ocurrir que una persona transgénero se sienta desorientada ante los cambios en la anatomía de sus genitales, por muy deseados que sean. En este caso es importante explorar nuevas formas posibles de estimulación y contacto sexual, aprendiendo a conocer el propio cuerpo. Para algunas personas, un programa de asesoramiento sexual para parejas también puede ayudar.

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